Un riche collectionneur, à bord de sa forteresse volante s'est mis en tête de capturer les très rares oiseaux légendaires Sulfura, Electhor et Artikodin résidant dans l'archipel Orange, dans le but de faire apparaître le " gardien des océans "(lugia), mais la capture des ses Pokémons provoquent des dérèglements climatiques ressentis sur toute la planète.
Pendant ce temps, Sacha participe à une fête traditionnelle sur l'île Shamouti, dont une vielle légende semble bien être la solution au problème.
sacha d'après les habitants de l'île serait "l''élu" capable de sauver la planète,pour cela il devra obtenir les trois orbes résidantes dans les trois îles des oiseaux,pour faire apparaitre le gardien des abysses,qui l'aidera à calmer les oiseaux et par conséquent arrêter les bouleversements climatiques.